Το Ενδοκρινολογικό Τμήμα, εκτός της κλινικής εξέτασης, παρέχει διάγνωση, αντιμετώπιση και πρόληψη σε όλο το εύρος των ενδοκρινολογικών παθήσεων και των συναφών προβλημάτων, όπως:
· Παθήσεις θυρεοειδούς – παραθυρεοειδών
· Υπόφυσης – υποθαλάμου
· Επινεφρίδιων
· Γυναικολογική Ενδοκρινολογία
Στην Affidea Κρήτης λειτουργεί επιπλέον το Παιδοενδοκρινολογικό Ιατρείο το οποίο έχει στόχο την ενημέρωση και εκπαίδευση των μικρών ασθενών και των οικογενειών τους.